A Comissão de Coordenação do Conselho de Cooperação Amazônica (CCOOR), formada pelos Embaixadores dos Países Membros da OTCA credenciados pelo Governo do Brasil, é um órgão de natureza consultiva e auxiliar do Conselho de Cooperação Amazônica. Acompanha o planejamento, a programação e a execução orçamentária da SP e avalia as atividades desenvolvidas no âmbito do Tratado, formulando recomendações ao Conselho de Cooperação Amazônica sobre diversas matérias de sua competência.